Минфин РФ в своем письме от 27.06.2016 № 03-07-10/37288 приводит порядок применения вычета по НДС заказчиком при строительстве недвижимости, если права по договору подряда получены им в порядке цессии.
Вычет применяется, если по договору уступки прав требования с первоначальным инвестором к организации перейдут все права по договору строительного подряда на проведение строительства объекта. Так компания будет наделена правами заказчика по отношению к подрядчику, осуществляющему строительство данного объекта.
В этом случае к вычету принимаются суммы НДС, предъявленные подрядной организацией после окончания строительства на полную стоимость выполненных работ, включая стоимость работ, выполненных до приобретения организацией права требования.
Недавно как раз заключал договор подряда (скачать если что можно здесь: http://www.freshdoc.ru/dogovor/dogovory_podryada/_dogovor_podryada_obschiy/) и возник вопрос с переуступкой. Тема оказалась очень кстати.