это как вариант учета в конкретной ситуации

п. 2 ПБУ 14 - оно не применяется в отношении материальных носителей (вещей), в которых выражены результаты интеллектуальной деятельности и приравненные ним средства индивидуализации.
41 можно бы было рекомендовать, если бы речь шла о получении носителя и его перепродаже 1:1. Может так во фрайчайзи 1с? А если мы получаем права на программу по лицензионному договору с 1 носителем, и сами тиражируем?

Если вы получили эталонную копию и с нее делаете тираж - вы заключили настоящий лицензионный договор, вы должны выплачивать вознаграждение правообладателю, а оно может быть:
- заранее фиксированным - тогда это вознаграждение относите не сразу в расходы, а через счет 97 с постепенным списанием (в течение срока использования по договору)
- переменным - в зависимости от разрешенного объема тиража - тогда это не единовременное, а периодическое (ежемесячное/ежеквартальное) начисление вознаграждения с отнесением на ваши расходы и без счета 97.