Универсальный отчет, фильтр по виду документа

Как при построении универсального отчета в бухгалтерии отфильтровать записи регистра с измерением документ по определенному виду документа?

Никак. В консоли отчетов можно внутри запроса задать условие "Документ.Ссылка ССЫЛКА "Документ.ПоступлениеТоваровУслуг". Можно попробовать сделать отбор по виду операции. Обычно определенному виду документа соответствуют свои операции (используя свое перечисление). Можно указать "ВидОперации в списке <список всех возможных операций по документу определенного вида>".