Для целей учета НДС не списано .. странно 1С 8.1 БП 1.6.21.6

Ни НУ ни к БУ это отношение не имеет. Наличие движений по регистру "НДС по партиям запасов" завист от настроек учетной политике по НДС.
А судя по тому, какая у вас вознилала проблема при регистрации с/ф на аванс, то может не только протестировать базу, а просто перепровести все документы контрагента, которые делают движения по этому регистру.

Спасибо. Но полное перепроведение за период с даты, предшествующей Поступлению товаров и услуг, я делала. Не помогло.

> 2. В БУ со счета 41.01 списано 3 единицы по партии Поступление товаров и услуг ПР000000351, остальные с других партий.
> 3. В НУ все списано правильно (2 единицы с этой партии и 5 - с других партий).

И где здесь в БУ списывается больше?

Нужно сделать полное перепроведение, вообще всех документов!

В Партии Поступление товаров и услуг ПР000000351 фактически поступило 2 единицы. А в БУ списывается 3. В ОСВ по по этой партии отрицательный остаток. Но есть несколько Поступлений этого товара по другим партиям.

а настройки праметров учета на закладке "Запасы" какие ? (по всем галочкам)

в учетной политике Способ оценки МПЗ  какой?

С настройками все в порядке. Документов в базе очень много. Все работает, кроме одного документа Поступления товаров и услуг. Повторяю. Я его пробывала удалять и делать вместо него новый. Но в реализации товара по этому новому Поступлению в БУ все равно идет ссылка на удаленный документ. При этом я посмотрела все регистры. Ссылки на удаленный документ нет.

этот документ по 3-му субконто "партии" ни где не проявляется?

выбрать
Период,
Регистратор,
СубконтоДТ3,
СубконтоКТ3
из регистрБухгалтерии.Хозрасчетный.ДвиженияССубконто(,,

ВидСубконтоДТ3 =Значение(ПланВидовХарактеристик.ВидыСубконтоХозрасчетные.Партии)
 ИЛИ
ВидСубконтоКТ3 =Значение(ПланВидовХарактеристик.ВидыСубконтоХозрасчетные.Партии)
)

Спасибо. Попробую чуть позже

Провела тестирование и исправление ИБ. Даже с помощью утилиты chdbfl.exe.  Нигде ошибок не показывает.Перепровела. В регистрах ссылку на укзанный документ не нашла.
Создала копированием новый документ Поступление товаров и услуг. В этом документе все нормально, но в содерании проводки БУ есть ссылка на старый документ. Заменила во всех документах ссылки со старого документа на ссылки на новый документ. Удалила старый документ Поступление  товаров и услуг. Еще раз "ровела тестирование и исправление ИБ. Даже с помощью утилиты chdbfl.exe.". Ошибок не обнаружено. При проведении документа Реализация товаров и услуг после этого появилдась ошибка
счет учета 41.01, склад Основной склад (партия <<Объект не найден> (137:9e26001e5830a88411deadd7131da64a)>)

Это все результат сбоя ИБ. Но как избавиться от этой проблемы?