Проблемы с реестром

у нас на предприятии, где я работал, мы тоже вели полученные сч-фактуры из-за того, что у нас на каждом сч-фактуре ставился акцепт  и только тогда НДС ставился на возмещение.
Мне пришлось переписать полностью отчёт книги покупок, чтобы туда попадали сч-фактуры так, как нам надо.

я не понял, зачем переписывать. Отразить полученный с\ф в книге покупок "с задержкой" можно и стандартным способом. И на алгоритм формирования отчета "Книга покупок" это никак не влияет. "Помечен" с\ф на включение в книгу - он и попадает в отчет. А автору вопроса надо формировать книгу покупок еще и в варианте "Журнал учета..." и все у него сойдется.