Книга покупок - ???

Нет, это не значит, что я не знаю, что это такое.
Вопрос в другом.
Как известно, для записей книги покупок данные формируются счетами-фактурами. А если их две с одинаковыми входящими номерами, то они обе попадают в отчет "Книга покупок", суммируются там, ну, и, понятно, бардак.

Это только меня так глючит?

28.3, 13.202

для этого совпадения только номеров не достаточно

Это только тебя так глючит, потому как данные формируются документами поступления, а не только СФ.

в отчет данные попадают, как я понимаю, из регистра НДС покупки. А там строки разные. А в отчет собирает вместе.
Походу, у меня и  правда глюки

Регистр НДС покупки формируется документом "Формирование записей книги покупок"