Ошибка при выгрузке данных в бухгалтерскую программу

"Здравствуйте! Подскажите пожалуйста что делать при такой ошибке : {Обработка.ВыгрузкаДанныхВБухгалтерскуюПрограмму.Форма.Форма(590)}: Значение не является значением объектного типа (Организация)
Организация    = СохраненныеНастройки.Организация;
Скажите что нужно делать в этом случае?"

Попробуйте удалить пользовательские настройки обработки.

а как это сделать?

Если обмен производится в XML-формате, то, скорее всего в конфигурациях объекты Организация различаются набором реквизитов. Чтобы объекты (элементы справочников, документы и т.д.) успешно передавались между базами, нужно чтобы они были совершенно одинаковы. Т.е. имена реквизитов, табличных частей и их реквизитов, их типы и порядок следования в структуре объектов были одинаковы.
Если у вас стандартные конфигурации - обновите их до последних релизов. Там всё согласовано.

И все-таки, как удалить пользовательские настройки обработки? Конфигурация обновлена до последнего релиза, но проблема осталась.

Можно сделать кардинально - почистить кэш.
Попробуйте удалить базу из списка и добавить заново.