Движения документа по регистрам, очередное чудо

а это не обязательно специально. Это могла быть банальная ошибка в коде этой обработки

какой обработки, например? я веду эту базу три года, я точно в десятом году никаких обработок не писала.

"СтруктураПроведенияПоРегистрамНакопления" - сия структура как заполняется?

в первой процедуре смотри

Там еще есть условие "ВыборкаПоТЧ.НДФЛ <> 0", который идет из "СформироватьЗапросПоНачисления(ВыборкаПоШапкеДокумента).Выбрать()". Там еще мог НДФЛ отсутствовать. Может пользователь раньше нужного времени формировал твой документ?

НДФЛ там отсутствует. Во всех документах. Это про другой регистр.

Вобщем при следующей подобной процедуре садись рядом с пользователем и проводите в режиме отладки.