Добрый день.
Зарплата и управление персоналом 2.5.100.1
Настройки программы:
При начислении НДФЛ принимать исчисленный налог к учёту
как удержанный.
Ведётся упрощённый учёт вазаиморасчётов
После обновления на последний релиз документ Зарплата к выплате формирует запись НДФЛ удержанный.