КПП крупнейшего налогоплательщика

Организация является крупнейшим налогоплательщиком, имеет два КПП для головной организации.
C 2017 года изменился порядок сдачи 6-НДФЛ и 2-НДФЛ для крупнейших налогоплательщиков - начиная с отчетности за 2016 год отчеты необходимо предоставить в территориальные налоговые органы.
В программе 1С ЗУП 2.5 для головной организации был установлен КПП, соответствующий крупнейшему налогоплательщику, все записи по учету НДФЛ с 2014 года сделаны с этим КПП. C 2017 года изменился порядок сдачи 6-НДФЛ и 2-НДФЛ для крупнейших налогоплательщиков - начиная с отчетности за 2016 год отчеты необходимо предоставить в территориальные налоговые органы.
В организации сложная многоуровневая структура подразделений, несколько десятков подразделений относится к головной организации, и несколько
десятков подразделений находятся в других 14 регионах.
Посоветуйте, пожалуйста, как корректно перейти на учет НДФЛ с "территориальным" КПП.