ВСЕГДА надо делать копии базы, ведь даже платформа перед запуском этого процесса предупреждает, чтобы вы не забыли этого сделать!
Остаётся только ждать результата, если прервать этот процесс, то скорее всего базе станет ещё хуже, чем было до этого. Конечно 20 часов тестирования для такой базы - это уже много для тестирования. Смотрите в диспетчере задач есть ли активность процесса 1cv8.exe и его размер.
А вообще, если у вас файловая БД, то перед всяким тестированием надо делать копию (не из конфигуратора, а копированием файла 1cv8.1cd). Потом желательно сперва прогнать файл базы данных через утилиту chkdbfl.exe которую можно найти в папке с платформой. А потом уже через конфигуратор запустить Тестирование и исправление БД со всеми галочками.