1. Проверить аналитику на счете 90.1.1 (субконто должно быть указано)
в программе база рассчитывается как 90.1.1 - 90.2.1 - 90.3
2. В справочнике Виды продукции (аналитика 90 счета), по которому у вас прошла выручка вид продукции должен быть указан Товар