Выплата аванса в % в середине месяца. Как настроить?

не важно.

Это очень важно!
Если просто 50% или сколько угодно процентов от оклада, то любой мало-мальски смышленый бухгалтер-расчетчик может посчитать, оклад 10000, аванс 30% от оклада (еще могут быть варианты с районным коэффициентом или без. Примем для простоты что без) - тогда берем 30% от 10000 и 3000 рублей заносим сотруднику в поле "Аванс" желаемую цифру - и при формировании ведомости на аванс он автоматически заполнится.
Если же хотите учитывать отработанное время... то это нереально.
Месяц не закончен - значит вы не знаете человек работал, не работал, сколько работал, был ли на больничном, в прогулах, или сдавал кровь за деньги.