Прием совместителя в ЗУП

Сотрудник работает на основном месте.Как его правильно учесть  как внутреннего совместителя в ЗУПе, принять приказом не получается, программа ругается?

А как ругается? Вроде внутренние принимаются без проблем.

Во первых такого понятия как совместитель нет, новым приказом принимаем сотрудника пишет сообщение: "работник уже работал в организации для повторного приема на работу необходимо создать нового сотрудника"!

Если я создам нового сотрудника то он будет в отчетах идти отдельно, как то не правильно, а как правильно?

Все правильно.
Действительно нужно создать нового сотрудника,а вот физлицо должно быть одно и тоже.