НМА

Скажите пожалуйста, относится-ли программа 1С к НМА?

Нет. У вас на нее нет исключительных прав на 1С

Тогда,подскажите пожалуйста, на какой счет ее списать?

на 97 счет, срок списания в соответствии с договором
если в договоре сроки не указаны, то тогда в соответствии с учетной политикой

Вопрос об учете программного обеспечения уже много раз обсуждался на форуме.
1. Учитесь пользоваться поиском. В окошке поиск сообщения наерите "программное обеспечение" или "расходы будущих периодов"
2. Когда вы обращаетесь с вопосом желательно, особенно когда вы спрашиваете о том как это сделать в программе указывать конфигурацию и релиз

http://www.buh.ru/forum/thread.jsp?id=405440
http://www.buh.ru/forum/thread.jsp?id=387593;