1. В константах надо предусмотреть наличие ЕНВД
2. В свойствах ЕНВД-подразделения указывается бух.проводка с галкой ЕНВД
3. Перед формированием ЕСН введсти документ "Бухгалтерский учет начислений...", где указать долю ЕНВД текущего месяца.
Остальное она должна сделать сама.