БП8.1 раздельный учет НДС, распределение НДС косвенных расходов

Подскажите, если кто сталкивался. Организация имеет выручку с НДС и без НДС (не 0% и не ЕНВД). На счете 90 и на счете 20 учет ведется в разрезе договоров (то есть раздельно по договорам с НДС и без НДС). Те затраты, которые нельзя прямо отнести к какому-то договору  - на 26 счете (косвенные). Почему программа заносит в регистр "НДС по косвенным расходам" все затраты (и с 20, и с 26)?  Статьи затрат с видом "не ЕНВД".
Такое ощущение, что раздельный учет по НДС продуман только для случая ЕНВД- не ЕНВД.
Или все же есть разумное решение в типовой конфигурации?

На счете 90.01.1 следует вести аналитику непосредственно по ставкам НДС (как и предложено в типовой конфигурации).
В 24-ом релизе по кнопке "Заполнить" именно косвенные расходы попадают в табличную часть! Т.е.все хорошо работает и затем верно распределяется. (Правда косвенные расходы у меня на 44-ом счете, про 26-ой не скажу)
Только один пунктик остается невыясненным. Пропорция, по которой распределяется НДС, отличается от той, что по итогам квартала на счете 90.01.1: Кредитовый оборот счета 90.01.1 не включает возвраты поставщику, а соотношение, которое предлагает программа, считает возвраты поставщику как реализацию.

Может и нормально, если в учетной политике этот факт описать? Или все же ошибОЧка?

Использовал для другого случая.