Один период работы делится на три!

1С:Предприятие 8.2 (8.2.10.77)
Зарплата и Управление Персоналом, редакция 2.5 (2.5.19.3)

при подготовке данных персучета по четырем сотрудникам
формируются по три периода работы, хотя период у всех
период был только один. Откуда прога берет такие данные?

Откройте периоды, посмотрите, вспомните что происходило с вашими сотрудниками в эти даты.

в том  всё дело, что в эти периоды с ними ничего не происходило!

Если бы с ними ничего в программе (!) не происходила, то период был бы 1. Программа не может импровизировать. Посмотрите, были ли кадровые перемещения, увольнения - приемы, отгулы /прогулы/отпуска без сохранения и т.п.

Откройте регистр "Основные начисления организации " и помотрите если разрыв в начислениях.

На разрыв стажа влияют в основном незакрытые "Отсутсвие по невыясненной причите".

Ну кто ж знает, как они проводят отгулы и что у отгула стоит в поле вид для СЗВ4