Возврат НДС за прошлый период

"Здравствуйте! Работаю бухгалтером недавно.ИП на общем режиме НДС 0%; и 18% . Разбирая бухгалтерию за 07 - 09 годы обнаружил что некоторая сумма НДС не подана к возмещению. Можно ли подать документы на возмещение этих сумм? И как правильно оформить декларацию?"

Согласно ст. 54 НК РФ при обнаружении искажений в исчислении налоговой базы, относящихся к прошлым налоговым периодам, перерасчет налоговых обязательств производится в периоде совершения ошибки, а не в периоде ее выявления.
Если ошибка относится к налоговому периоду более чем трехлетней давности, то перерасчет налоговых обязательств осуществить нельзя, так как согласно п. 4 ст. 89 НК РФ выездной налоговой проверкой могут быть охвачены только три календарных года деятельности организаций-налогоплательщиков, непосредственно предшествующих году, в котором вынесено решение о проведении проверки. А если инспектор не может проверить, была ли ошибка, то у налогоплательщика нет возможности для ее исправления.
Поскольку в налоговом учете ошибки исправляют в том периоде, когда они были допущены, в такой ситуации организация должна исправлять налоговые декларации, которые уже были сданы. Для этого используют бланки деклараций, которые действовали в соответствующем периоде.

И сразу готовьтесь к камеральной проверке. Вам это надо? Вы учет не вели, откуда знаете как в эти годы велся учет. Пройдет камеральная проверка и вполне может оказаться, что налоговая найдет столько нарушений, что ещё и доплачивать придется. И что потом скажет Ваш работодатель?