Бухгалтерия 8.1, релиз 1.6.24.7, Учет убытков по ПБУ 18.02

"В первом квартале получена прибыль 1000 т.р. - всё расчитано документом Закрытие месяца правильно;
во 2-м квартале получен убыток 500 т.р.,
финансовый результат по полугодию прибыль 500 т.р., документом Закрытие месяца сформированы проводки по признанию ОНА Д-т 09 Убытки К 68.04.2, соответственно в балансе появился ОНА в сумме 100 т.р. приналичии прибыли за полугодие 500 т.р., чего не должно быть.
Поясните почему так происходит при закрытии месяца, как решить эту проблему без введения ручных корректировочных проводок?"

не совсем понятно утверждение про убыток во втором квартале? убыток по окончании 2 квартала или по результатам 2 квартала?

по результатам 2 квартала

лучше на Мисте продолжим!

Почитай ПБУ 18.