отражение ндс к зачету 1с КА

Уважаемы форумчане подскажите пожалуйста - прешли на комлексную 1.1, и возник вопрос: как быть если нужно к зачету НДС отразить не по полной сумме поступления (проводка Дт.68.02/Кт.19.03). в БП делали отражение НДС к вычету и редактировали суммы, но в КА почему то этот же документ не делает проводок

связи с чем не всю сумму берете к зачету?

часть суммы идет на ЕНВД... скорее всего что то делаем неправильно - направьте на истинный путь)

в учетной политике соответсвующая галка о раздельном учете НДС, по итогу квартала - проведение по регистрам НДС, затем "распределение НДС косвенных расходов", затем книга покупок и продаж