Скидки на товар при партийном учете

Помогите!!! Основной вид деятельности розничная торговля. Покупателям предоставляем различные скидки. Оперативный учет ведется в 1С Розница. Затем выгружаю в 1С Бухгалтерия 8,2 и тут самое интересное. Учет партийный ФИФО. При проведении отчета о розничных продажах выходит служебное сообщение: "Для целей учета НДС не списано 1,000 товара Шорты Blue White джинсовые пуговками, счет учета 41.11, склад TRENDY ТЦ Дарс (партия <Поступление товаров и услуг ЦБР00000001 от 22.05.2013 0:00:01>)". Это как раз в тех случаях, когда цена товара (которая выставляется автомтом) больше суммы за товар поскольку была сделана скидка. и при проведении данного отчета о розничных продажах оборотка по 42.01 горит красным. Я попробовала сделать переоценку на позицию на которую была скидка и в отчете о розничных продажах поставить сумму без скидки. вроде краснота уходит. НО выручка по 62 не сходится!!!!
Подскажите как учитывать скидки при использовании партийной системы?!