Переплата по сверке с МИФНС

Доброго времени суток. Подскажите, пожалуйста, как быть. По сверке с налоговой вылезла переплата по земельному налогу и по налогу на имущество. По их данным переплате более 3 лет, аж до 01.01.2016 года якобы была, далее посмотреть не могут, базы нет у них. Переплата большая (хватит почти на 3 года начислений земельного налога), Учреждение бюджетное, естественно никаких несанкционированных платежей по уплате налогов не было. Откуда взялась переплата непонятно. Что делать? Очень не хочется вносить исправления ошибками прошлых лет. Можно ли текущим годом отразить? Как правильно это сделать? Чревато ли чем? Подскажите, плиз