При расчете среднего заработка нужно учитывать суммы начислений, а не выплат. Если больничный начался 01 марта, то Вы и должны были расчитывать средний заработок из сумм, начисленных до 01.03. При чем здесь выплата премии в апреле по итогам 1 квартала. Ведь наверняка Вы начислили премию не ранее 31.03. А период март Вы не должны учитывать. Если, конечно, Вы начисляете премии ежемесячно, то их нужно и учитывать (январь и февраль).