При обновлении комплексной в справочниках "ХозОперации", "ПроводкиХозОпераций", "ДвиженияРегистров" помечаются на удаление элементы , которые были внесены вручную, изменены и не соотвествуют шаблону (посмотрите обработки "Обновление ИБ, НастройкаФормированиеПроводок"). <br>При проведении документа, если из его модуля вызывается процедура глПриПроведении(... - происходит формирование бухгалтерских проводок, на основании движений документа по регистрам оперативного учета (Документ принадлежит оперативнному и бух учету - например ПКО или Реализация). Посмотрите - вот в этой процедуре глПолучитьТаблицуПроводок(... формируется таблица проводок документа. И если нужный элемент справочника помечен на удаление, (например в справочнике "ПроводкиХозОпераций" ) то бух. проводка не будет сформирована. <br>При обновлении я делаю всегда так:<br>Перед обновлением конфигурации нужно провести все документы и сохранить базу. Обновляем, опять проводим все документы. В отдельной папке восстанавливаем базу до обновления. В обоих базах запускаем отчет "Оборотно-сальдовая ведомость" - смотрим, если в оборотках бух итоги отличаются, то далее ищем причину в обновленной базе, сравнивая бух. итоги.<br>