Проблема скорее всего с этим ПК. Размер базы какой? Таскменагером посмотри загрузку процессора, объем свободной опер.памяти в момент тормозов, какая прога больше всего грузит процессор, сколько памяти отъедает 1С. Попробуй временно отключит антивирь.