Счет-фактура при УСН

У нас упрощенная система налогооблажения. До этого счет-фактуры не использовала. А сейчас мы являемся налоговым агентом. И нам самим надо выписать счет-фактуру. Но в программе стоит просто общая сумма, без выделения НДС. Можно ли настроить, чтобы в счет-фактуре НДС выделялся?

> У нас упрощенная система налогооблажения. А сейчас мы являемся налоговым агентом.

На каком основании, какая причина?

Мы арендуем объект муниципальной собственности и самостоятельно перечисляем НДС в бюджет.