Базовая поверх обычной?

Локальная - это базовая поставка и есть вроде. А другая, которая обычная, может работать локально и по сети.
Конфликта не будет. Просто чтобы зарегистрировать базовую, требуется вытащить на время ключ основной поставки.
Но т.к. у вас она уже установлена и зарегистрирована, то проблем быть не должно.

Большое спасибо за разъяснения! Т.к. не понять, на какой системе налогообложения будем работать в следующем году, приняла решение купить не базовую версию Бухгалтерии.