Переход на редакцию 6.1 Бухгалтерии для бюджетных учреждений

В файле Release.txt сказано, что сперва необходимо выполнить свёртку базы, а уже затем выполнять переход на КБК2009, а в "Инструкция по Переходу на редакцию 6.1" в демо-версии сказано, что переход делается до свёртки. Как правильно?

свернуть, потом обновлять.

Меня интересует, в какой момент необходимо делать переход на КБК2009

правильнее так, как в демо-версии.

Тоесть сперва выполняем переход на новые КБК2009 а уже потом делаем свёртку базы

Да не обязательно, я так думаю для замены кбк оба варианта одинаковы,
т.к. обработка замены ищет нужный кбк везде где он только может быть, и меняет на указанный, а свертка базы это ничто иное как удаление старых документов, и создание вместо них операций, так что я думаю что разницы нет.

Обработка удаления старых КБК DELBK.ERT идущая в новом релизе, очевидно является старой и расчитаной на замену КБК2007-2008 Это видно и по коду и при запуске она сообщает, что запускается повторно.
Может я что-то не так делаю или эту обработку необходимо скачать отдельно?

Можно как-то обойтись без этой обработки?

При загрузке новых КБК при загрузке в пункте "Коды доходов по БК" выходит сообщение "Код не уникальный" и "обновление классификатора невозможно", как с этим бороться?

Сначала очистить справочник.
Или отключить контроль уникальности.