Когда я, уже не надеясь, попробовал обновиться еще раз, обе мои бухгалтерии обновились! Так и не понял, что это было... Зато теперь с ЗУП то же самое. Первая база без проблем обновилась, а со второй сейчас то же самое, что тогда с бухгалтерией. Мысль по этому поводу возникла одна - вернуться пока что в 8.1.