Документ "Прием на работу"

А если делать изменения графика работы непосредственно в справочнике "Сотрудники"?

Сделать то можно, но хотелось бы разобраться, где определяется порядок документов (к стати документ "Ввод расчета списку сотрудников" тоже оказался перед "Прием на работу")

Попробуйте провести переиндексацию.

Это не помогло, видимо в системе есть определенный порядок документов

Дело в том что такое поведение только у вас.
Из описания
" все документы в системе 1С образуют единую хронологическую последовательность. Для этого каждый документ имеет дату и время. Даже если два документа имеют одинаковую дату и одинаковое время, они все равно распологаются в определенной последовательности, определяемой порядком их ввода в систему"

Видимо это все таки не так, ведь документ "Прием на работу" был занесен первым, а в списке он не первый

Если изменить время документа?

что-то я не припомню в ЗиК ни одного документа, в котором можно-было бы установить время. Но дело не в этом. График работы - периодический реквизит. И период - день, а не день с минутами-секундами (в смысле 01.01, 02.01, но никак ни 01.01 17:05). Поэтому: как бы Вы не комбинировали, в т.ч. и с программным изменением реквизитов документов Дата-Время, последний док-т всегда всегда перебьет состояние реквизита, установленного предыдущим, причем по ДАТЕ НАЧАЛА. При всем при этом кадровое перемещение Вы не сможете ввести "раньше" приема на работу (нельзя перемещать непринятого сотрудника).

Так в том то и дело, что сначала вводился прием на работу, а потом кадровое перемещение, а в списке периодических реквизитов они стоят наоборот.

Такое поведение было недавно замечено когда документы вводились за прошлый период. Например текущий расчетный -ноябрь. Прием на работу и кадровое перемещение делается за октябрь.
Тогда действительно в списке периодических реквизитов такой порядок.