Некоммерчекая организация (счет 86)

Как должен закрываться счет 86 некоммерческой организации? На всю полученную сумму финансирования или только ту, которая списалась по банку?

На 86 счете должен отражаться остаток средств целевого финансирования. Списываться должны только средства, использованные в соответствии с утвержденной сметой расходов.

То есть "кассовые расходы"?

Имеете в виду, по кассовому методу? Не все. Например, начисление зарплаты и страх.взносов отражаете сразу проводками Д 86 к 70, Д 86 К 69.

В январе месяце было только начисление з/п и налогов, сделала проводки. Сумма зависла на счете 86.Поступления средств были только в феврале. Как закрыть в январе 86 счет, закрываю вручную на 20 счет, не идет баланс. В активе эта сумма на "затартах в незавершенном производстве" с минусом, в пассиве "в задолженности" с плюсом.?

20 счет вы используете только если у вас есть какая-либо коммерческая деятельность, и то скорее 26 счет, а не 20. Если коммерческой деятельности нет - только 86 счет.
Почему вы думаете, что 86 счет должен ежемесячно закрываться? Это не 90, не 20 и не 26 - на нем совершенно спокойно может быть остаток.

Закрываю 86, не закрываю 86 ,Баланс то не идет... Как правильно?

Оборотная ведомость идет?

Обороты одинаковые, сальдо тоже

Тогда сверяйте по строкам баланс и оборотную ведомость - смотрите, что из оборотки не попало в баланс. От результатов уже будем отталкиваться.