Откуда взялся убыток прошлого периода?

> формируется отчет по закрытию месяца,

Это в отчете, а действительно есть проводки по погашению убытка прошлых лет?

Обратитесь к программисту, через отладчик можно понять почему.

"Закрытие месяца" производится ежемесячно. Если при закрытии текущего месяца (например, января), в налоговом учете образовался убыток, то программа формирует ОНА, называемый "Убытки прошлых периодов". Если по результатам, скажем двух месяцев - января и февраля - в налоговом учете образуется прибыль, то ОНА, образованное по результатам января, погашается. Если убыток по результатам двух месяцев меньше, чем по результатам одного месяца, погашается часть ОНА и т.д.