Аналитика счетов расчетов

На счетах расчетов 60.01,02  и 62.01.02 есть субконто 3 (документ).
На этом субконто нередко (у нас по крайне мере) бывает отрицат сальдо.
Допустимо ли всегда игнорировать этот факт?
Будут ли правильно работать при этом учетные механизмы программы
(зачет авансов с отгрузками и покупками, вычеты НДС при отгрузках и т.д.).
Может кто-то поделиться своими знаниями по этому вопросу??
Хотел спросить у разработчиков - получил формальную "отписку".

Александр Хмелёв,при корректно указанных счетов авансов и счетов расчетов, а так же с упорядоченной последовательностью документов, такой картины не должно наблюдаться и желательно такого не допускать.

Александр Хмелёв, не стоит оставлять отрицательные остатки по третьему субконто, т.к. отрицательный остаток считается ошибкой и не участвует затем в анализе задолженности при формировании проводок.
Например отриц.остаток на сч.62.01 не является авансом и не будет зачтен при следующей отгрузке.
Проведение документов в хронологической последовательности обычно решает проблему при автоматическом зачете авансов. Если зачитывали руками "по документу" ... отслеживать и исправлять.