Неспециалист, "Поэтому на момент регистрации оплаты работы в праздничные и выходные командировка уже должна быть зарегистрирована в программе. Если командировка отменяется или исправляется в будущих периодах, то пришедшиеся на ее изначальный период начисления все равно не будут учитываться в расчете среднего заработка."
Но теперь документ начисления праздничных не достаточно просто перепровести после изменений в нем. Его нужно сделать не проведенным, а потом провести. Т.е. проще все изменения делать в не проведенном документе начисления праздничных. В вашем случае нужно сделать эти документы не проведенными и снова провести. Документы командировок трогать не нужно.