Помогите, пожалуйста!!! Какую сумму налога УСН заплатить?

Помогите, пожалуйста!
У меня такая ситуация.
За 9 месяцев сдали неправильную декларацию и заплатили неправильный налог(например 1000руб. ). Я сейчас подготовила уточненку. Получилось, что мы не доплатили налог.В уточненке сумма налога за 9 месяцев равна 2000 руб.
За год сумма налога получилась равной 1500 руб. Т.Е. 500 руб. к уменьшению.
Как нам лучше заплатить. Доплатить 500 руб. согласно годовой декларации. Или доплатить 1000 руб.?
И что мне делать с этими 500 руб. к вычету в бухгалтерском учете. Мне их начислять или не надо. И как потом уменьшить налог на эту сумму. Первый раз сталкиваюсь с такой ситуацией. Помогите, пожалуйста!