Какой вариант построения информационной системы выбрать?

Перед нами встал вопрос выбора, как организовать систему управления предприятием клиента. При условии, что нужно совместить управленческий учет (отраслевой) и регламентированный (бухгалтерский и налоговый). Кратко свои соображения привожу здесь:  http://1c-ufa.ru/content/view/110/52/ но думаю многие сталкивались с подобной дилеммой.
Использовать раздельные системы, как  вариант Бухгалтерия и Торговля или выбрать Комплексный вариант. Вы возможно уже сделали свой выбор, приведите пожалуйста свои доводы "за" и "против". Думаю многим будет полезно. Планирую расширить статью таблицей с плюсами и минусами вариантов.