вирус и 1с

вполне может быть сбой системы и полетела FAT таблица частично...вот и не на те области диска ссылается.

Аналогичная ситуация
очень по симптомам похоже на http://vil.nai.com/vil/content/v_342.htm
Пролучил архив базы, все небольшие dbf заполнены мусором полностью,
большие (>100 кб) только в начале и конце файла
Надеюсь на компьютере клиента останется вирус как и был - попробую вытащить вживую

на падение диска непохоже - побиты исключительно dbf  и очень странным способом.

впрочем, может быть идея автора вируса образца 1988 кого-нибудь ещё вдохновила?

К сожалению вдохновила...
Я был слишком оптимистичен.
Это http://www.securelist.com/ru/descriptions/197694/Virus.Win32.Nakuru.a
Видимо клиенту неповезло...
Кое-что из середины больших файлов я вытащу, но не всё явно...