Если работники-договорники оформлены в программе по договору подряда, то в этом случае ФСС и так не будет начисляться, а для ФОМС можно индивидуально для каждого договорника изменить сведения для расчета ЕСН: в справ. Сотрудники - закладка Налоговый учет - Изменить - Сведения для расчета ЕСН - снять галочку напротив ФОМС, поставить дату начала действия.