Аналитический учет в 1с Бухгалтерия 8

А как быть в авансовом отчете, когда подотчетник покупает ТМЦ на разные склады? Приходиться заводить другой авансовый отчет для другого склада.

Да, другового выхода нет, Так же как и в документе поступления товаров и услуг.
Обычно, если поступает материал от одного поставщика, то это номенклатура одного и того же типа, которая учитывается на одном складе.
Может вам делать поступление на один склал, а потом оформлять перемещение.

нет нам это не удобно, т.к.  увеличится документооборот, и собирать подписи (сдал принял)замучаемся. Может программисты 1с учтут пожелания и доработают?