Вопрос по объединению конфигураций ЗиК.

не получается очистить базу((
там сотрудники остаются принятыми на работу, а документы удалены((

Я бы сделал так. Взял чистую базу и спомощью обработок, например INPUT OUTPUI перенес сотрудников из обеих баз туда. Предварительно проверил бы табельные номера. Зате небольшой обработкой ОсновнойЭлемент=ТекущийЭлемент(). Такая вещь для чистых баз работала не раз.

Я бы до конца года вел обе базы, а объединял потом только отчетность! А с нового года уже в одной!

Зачем вести в двух, если это новая организация?

Затем, что объединять легче с начала года! Это мое мнение, но вариантов, конечно, много!

В новом предприятии ЗП считается с нуля.

Т.е. в "новое предприятие" сотрудников принимаем или переводим?

Тут надо начинать с вопроса: Сотрудники этих двух организаций были уволены и вновь приняты или переведены?? Ведь во втором случае вам придется считать что-то по среднему и тогда ваши мучения оправданы, а если все сорудники вновь приняты, то берите чистую базу и вперед.