1С:Торговля и Склад. Почему после ввода долгов покупателей за товары, долги в отчете "График платежей" показаны в виде просроченных платежей, даже если долги уже оплачены?

Вероятнее всего не произошло погашение долга по документам ввода остатков, например, не совпадают ставки налогов в документе ввода остатков и документе оплаты. Введенная оплата зафиксировалась не как оплата долга покупателя, а как авансовый платеж.

Для того, чтобы проверить погашение долга по документам ввода остатков можно вывести отчет "Ведомость по контрагентам" с детализацией по кредитным документам и документам движения.