счет 00

Да, правильно. Остатки введены неверно. Верно введенные остатки, это когда сумма дебета счета 00 равна сумме кредита счета 00 за день введения остатков.

Вы себе на бумажке напишите, какие у вас остатки на каком счете, и попробуйте свести баланс. Как получится - переносите в 1С.

А проводку на уставный капитал Д 00 К 80 - делали? Что-то я в ваших записях ее не увидела (или может смотрела невнимательно?)

Нет не делала, просто до 2008 года была упращенка, соответственно уставный капитал  там и должен быть или необязательно?

Уставный капитал у юр. лица должен быть в любом случае.

а чем ваша фирма таким занимается, что у неё под нуль запасы товаров, нет никаких задолженностей по дебету и кредиту? Как такое вообще может быть? Есть только остатки по невыплаченной ЗП, налогам и остаток на банк. счету и то несбалансированные

"Волшебные палочки производит"

Из воздуха? Иначе были бы запасы дерева...

На то они и волшебные!