Исключение из реестра субъектов МСП: когда может произойти и что делать исключенным компаниям

Причины исключения из реестра субъектов МСП

10 июля 2026 года ФНС обновила данные Единого реестра субъектов малого и среднего предпринимательства. Несмотря на увеличение общего количества организаций и ИП, присутствующих в реестре по сравнению с показателями прошлого года (увеличение на 3,5%), из реестра все же была исключена часть действующих представителей малого и среднего бизнеса. 

Напомним, чтобы считаться малым предприятием доходы компании должны составлять не более 800 млн рублей, а численность работников – не более 100 человек. Для средних предприятий сумма доходов ограничена суммой в 2 млрд рублей, а численность работников не должна превышать 250 человек. Микропредприятием считается компания с доходом не более 120 млн рублей и числом работников не более 15 человек (п.2 ч.1.1 ст.4 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ). При несоблюдении данных лимитов компания подлежит исключению из реестра как несоответствующая обязательным критериям отнесения к субъектам МСП.

Исключению из реестра МСП компания подлежит и в случаях, если доля участия в ее уставном капитале других организаций и ИП, не отнесенных к субъектам МСП или являющихся иностранными резидентами, превысит 49% (доля участия государства, муниципалитетов и общественных организаций не должна превышать 25%). Также компанию могут исключить из реестра в 2026 году, если она не представит обязательную отчетность о доходах (налоговые декларации по налогу на прибыль, по УСН, 6-НФДЛ и т.д.) и среднесписочной численности работников за истекший 2025 год.

Несмотря на то, что указанная отчетность должна представляться, как правило, в начале года, для целей формирования реестра МСП ее необходимо представить до 1 июля 2026 года. Дата 1 июля установлена не случайно. Именно в этот момент обновляет реестр МСП, исключая из него те компании, которые не представили отчетность о численности работников и доходах за истекший год (п.5 ч.5 ст.4.1 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ).

Поэтому, если к 1 июля 2026 года компания не отчиталась за прошедший год, 10 июля 2026 года ее исключат из реестра на основании решения ФНС.  

Что делать, если компанию исключили из реестра МСП

Для начала следует проверить реестр на предмет наличия или отсутствия в нем сведений об организации или ИП. Сделать это можно на главной странице Реестра субъектов МСП, указав в поисковой строке сведения о компании. Для поиска организации в поисковой строке нужно указать ее наименование, ИНН или ОГРН, а для ИП – ФИО, ИНН или ОГРНИП. 

Если компания находится в реестре, система выдаст сведения о ней: категорию МСП, место регистрации и дату внесения в реестр. Дата исключения из реестра в таком случае отсутствует. Если же налогоплательщика исключили из реестра, напротив его именования будет отмечено, что он не является субъектом МСП, с указанием даты исключения из госреестра.

Такую проверку имеет смысл проводить на регулярной основе. Как минимум, проверять реестр следует не менее одного раза в год после 10 июля (момент обновления реестра). Если по результатам проверки выяснится, что компания больше не является субъектом МСП, она может предпринять действия по восстановлению в реестре МСП.  Результативность таких действий будет зависеть от основания исключения компании из реестра.

При исключении из реестра по причине превышения лимитов по величине доходов и количеству работнику восстановить статус субъекта МСП можно будет только в следующем году, если по итогам 2026 года доходы и численность работников не превысят значений, указанных в ч.1.1 ст.4 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ. Если же компания исключена из реестра по причине непредставления отчетности, восстановить статус субъекта МСП она может и в текущем году. Для этого требуется сдать ранее не представленную отчетность о величине доходов и численности работников за 2025 год.

Отметим, что отдельного отчета о среднесписочной численности работников в настоящее время нет. Сведения о среднесписочной численности представляются работодателями в составе расчета по страховым взносам – РСВ, направляемого в ФНС, и Раздела 2 формы ЕФС-1 (сведения о начисленных страховых взносах на травматизм), который сдается в СФР.

Вид представляемой отчетности для целей восстановления в реестре субъектов МСП зависит от категории налогоплательщика и применяемой им системы налогообложения. В зависимости от указанных критериев в налоговое ведомство за 2025 год следует направить:

• декларации по налогу на прибыль организаций, по УСН, по ЕСХН, 3-НДФЛ (для ИП на ОСНО);

• единую (упрощенную) налоговую декларацию (для компаний, у которых в 2025 году отсутствовала деятельность и объекты налогообложения);

• РСВ с отражением среднесписочной численности на титульном листе.

После сдачи отчетности компании нужно подать в ФНС заявление через специальный сервис. В заявлении следует указать на соответствие налогоплательщика критериям, установленным ч.1.1 ст.4 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ, и на факт устранения ранее допущенных нарушений (представление отчетности за прошедший год).

Если ФНС не выявит в представленной отчетности никаких нарушений, компанию восстановят в реестре МСП 10-го числа месяца, следующего за месяцем представления отчетности ч.5 ст.4.1 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ.

Уплата страховых взносов при исключении из реестра субъектов МСП

Главным негативным последствием исключения из реестра субъектов МСП является лишение права на применение льготных тарифов страховых взносов, установленных для представителей малого и среднего бизнеса (пп.17 п.1 ст.427 НК РФ, ст.3 Федерального закона от 24.07.2007 №209-ФЗ).

Напомним, сейчас субъекты МСП, осуществляющие деятельность в сфере обрабатывающих производств, вправе уплачивать страховые взносы по льготному тарифу в размере 7,6% (п.2.5 ст.427 НК РФ), а осуществляющие приоритетные виды деятельности – по льготному тарифу в размере 15% (в п.13.3 ст.427 НК РФ).

Пониженный тариф перечисленным страхователям разрешается применять с 1-го числа месяца, в котором сведения о плательщике внесены в реестр, и до 1-го числа месяца, в котором плательщик исключен из данного реестра (письмо Минфина от 19.04.2024 № 03-15-08/37041).

При исключении компании из реестра МСП право на уплату взносов по пониженным тарифам она утрачивает. Вместе с тем, это не означает, что ей следует пересчитать страховые взносы по общеустановленному тарифу в величине 30% с начала 2026 года и представить в ИФНС уточненные РСВ. Исключение из реестра МСП не свидетельствует о незаконности применения льготных тарифов страховых взносов с начала года.

Поэтому обязанность по уплате взносов по общему тарифу в размере 30% у страхователя возникает только с 1-го числа месяца, в котором он был исключен из реестра МСП. Сдавать уточненную отчетность и пересчитывать ранее уплаченные взносы по общему тарифу при этом не требуется (письмо ФНС от 16.01.2024 №ЗГ-2-11/473@). Причем при восстановлении компании в реестре МСП у нее снова появляется возможность исчисления и уплаты страховых взносов по соответствующему льготному тарифу с 1-го числа месяца, в котором сведения о компании были восстановлены в реестре.

В материале использованы фото: panacea_stock / Shutterstock / Fotodom.