Обзор налоговых споров от ФНС за 1 квартал 2025 года: недостоверные данные в личных кабинетах, применение пониженных ставок НДС и переквалификация договоров с самозанятыми

26.08.2025

ФНС в письме от 24.06.2025 №БВ-4-7/6081@ опубликовала Обзор судебных позиций по вопросам налогообложения за I квартал 2025 года (далее – Обзор), разрешенных Конституционным и Верховным Судом РФ. В обзоре представлены споры о применении льготных ставок по НДС, переквалификации договоров с самозанятыми, возврате переплаченных налогов и др.

Обзор уже направлен в налоговые инспекции для практического применения при проведении проверок организаций и ИП. Рассказываем, какими позициями судов теперь станут руководствоваться налоговые органы, доначисляя компаниям налоги.

Недостоверные сведения в личных кабинетах налогоплательщиков

В п.4 Обзора ФНС рассказала о деле по оспариванию положений ст.11.2 НК РФ «Личный кабинет налогоплательщика».

Налогоплательщик обратился в Конституционный Суд РФ с требованием о признании неконституционной ст.11.2 НК РФ. По его мнению, указанная норма безнаказанно позволяет налоговым органам размещать в личных кабинетах организаций и физлиц любые недостоверные сведения, которые не соответствуют действительной налоговой обязанности плательщиков.

Обязать налоговиков удалить недостоверные сведения из личных кабинетов невозможно. Размещение недостоверных данных о суммах начисленных налогов вводит плательщиков в заблуждение и может приводить к излишней уплате налогов. В связи с этим, по мнению заявителя, оспариваемая норма подлежит частичной отмене и изменению в части установления возможности удаления из личных кабинетов недостоверной информации.

Рассмотрев доводы заявителя, Конституционный Суд РФ в определении от 27.02.2025 №315-О не нашел оснований для корректировки ст.11.2 НК РФ. Суд пояснил, что если налоговая инспекция ошибочно отражает в личном кабинете налогоплательщика недостоверные данные о начисленных налогах, то это не нарушает права налогоплательщика.

Сведения о расчетах с бюджетом, отражаемые в личном кабинете налогоплательщика, сами по себе не влияют на размер его налоговой обязанности. Налогоплательщики не обязаны уплачивать налоги именно в той сумме, которую рассчитывают налоговые органы. Отражаемые в кабинетах сведения о рассчитанных налогам могут быть перепроверены налогоплательщиками самостоятельно.

Если ИФНС по ошибке разместила в кабинете недостоверные сведения о суммах налогов, то такие налоги не подлежат уплате. Доступ к сведениям, размещаемым в личном кабинете, имеет только сам налогоплательщик. Такие сведения не могут влиять на его деловую и налоговую репутацию. Поэтому, заключил КС РФ, оспариваемая ст.11.2 НК РФ не нарушает права налогоплательщиков и не подлежит отмене.

Условия для применения льготной ставки НДС 10%

В п.5 Обзора рассмотрен спор о доначислении организации НДС по факту необоснованного применения ею льготной ставки налога.

Основанием для доначисления налога явилось применение организацией ставки НДС 10% в отношении операций по реализации товаров, не отнесенных к продуктам питания. В ходе проверки налоговая инспекция установила, что компания применяла льготную ставку к реализации семян. С точки зрения ИФНС, ставка НДС 10% может применяться исключительно к реализации продуктов питания, а семена предназначены для осуществления сельскохозяйственной деятельности и не могут рассматриваться в качестве продовольственной продукции.

Суды нижестоящих инстанций поддержали налоговую инспекцию, подтвердив, что организации не вправе применять ставку НДС 10% в отношении реализации продукции, не являющейся продуктами питания и предназначенной для производственных и сельскохозяйственных нужд. Поскольку реализуемая продукция не предназначалась для приема в пищу населением, то организация, по мнению судов, не имела права на применение льготной ставки НДС 10%, а должна была применять общую ставку налога в размере 20%.

Разобравшись в материалах дела, Верховный Суд РФ в определении от 27.01.2025 №305-ЭС24-17887 №А40-143474/2023 отменил решения нижестоящих судебных инстанций и занял позицию организации-налогоплательщика.

Суд указал, что перечень продукции, реализация которой облагается НДС по льготной налоговой ставке 10%, установлен в соответствии с постановлением Правительства РФ от 31.12.2004 №908. Если код реализуемой организацией продукции соответствует тому или иному коду, представленному в указанном перечне, то этого достаточно для применения льготной ставки НДС 10%.

Нормы налогового законодательства не требуют, чтобы реализуемые товары из данного перечня могли использоваться (употребляться) непосредственно в пищевых целях. Указанный перечень продукции включает в себя как продовольственные пищевые товары, так и продовольственные непищевые товары, которые в процессе роста или переработки преобразуются в дальнейшем в пищевую продукцию. Поэтому ВС РФ признал, что решение ИФНС о доначислении организации НДС во ставке 20% противоречит закону и нарушает права налогоплательщика.

Доначисление НДФЛ по факту сотрудничества с самозанятыми

В п.8 рассмотрен спор о доначислении НДФЛ индивидуальному предпринимателю, который привлекал к выполнению работ самозанятых, применяющих специальный налоговый режим «Налог на профессиональный доход» (НПД).

Основанием для доначисления налога явилась переквалификация гражданско-правовых договоров, заключенных с самозанятыми, в трудовые договоры. Не оспаривая саму переквалификацию, ИП обратился в суд с иском, в котором потребовал пересчитать доначисленную ему сумму НДФЛ в сторону уменьшения. По мнению ИП, при расчете НДФЛ налоговая инспекция обязана была учесть уже уплаченные самозанятыми суммы НПД.

Суды нижестоящих судебных инстанций удовлетворили исковые требования налогового агента и уменьшили доначисленную ему сумму НДФЛ. Суды исходили из того, что одни и те же доходы физлиц (самозанятых) не могут одновременно облагаться НДФЛ и НПД. Поскольку самозанятые уже заплатили с полученных ими доходов НПД, то, по мнению судей, при переквалификации договоров ГПХ сумма НДФЛ должна быть уменьшена на величину налога, уплаченного работниками в статусе самозанятых.

Не согласившись с решением судов, налоговая инспекция оспорила их в Верховном Суде РФ. Отменяя решения нижестоящих судов, ВС РФ в определении от 03.02.2025 №А76-20897/2023 признал изначальный расчет сумм НДФЛ, доначисленных предпринимателю, законным и справедливым.

ВС РФ отметил, что налоговый агент, не исполнивший свою обязанность по исчислению, удержанию и перечислению НДФЛ в бюджет, оплачивает данный налог за счет собственных средств (п.10 ст.226 НК РФ). Суммы же НПД, ранее уплаченные самозанятыми и учтенные на их ЕНС в качестве положительного сальдо, являются средствами самозанятых.

Суммы НПД, излишне уплаченные в бюджет, могут быть скорректированы самозанятыми в случае их возврата. Возникшая в результате такой корректировки переплата (положительное сальдо ЕНС) находится в распоряжении самого физлица (самозанятого) и подлежит возврату только по его заявлению.

В этой связи переплата НПД не может быть произвольно зачтена в счет уплаты НДФЛ в отсутствие соответствующего волеизъявления плательщика НПД. Вернуть переплату самозанятые могут путем направления в ИФНС соответствующего заявления. Поэтому, заключил ВС РФ, при переквалификации договоров с самозанятыми НДФЛ следует доначислять без учета ранее уплаченных самозанятыми сумм НПД.

Сроки возврата переплаченных налогов

В п.10 Обзора представлен спор о возврате налога на имущество организаций, уплаченного до 2023 года.

ИФНС отказала в возврате переплаченного налога со ссылкой на то, что организация пропустила 3-летний срок на возврат налога. Организации не удалось оспорить решение налоговой инспекции в судах нижестоящих инстанций. Отказывая в удовлетворении исковых требований налогоплательщика, суды исходили из того, что 3-летний срок на возврат налоговой переплаты следует исчислять с момента уплаты авансовых платежей по налогу. Поскольку на дату подачи заявления о возврате переплаты с момента внесения авансовых платежей по налогу прошло более 3 лет, то, по мнению судов, организация утратила право на возврат излишне уплаченного налога.

Налогоплательщик не согласился с решениями судов, и спор дошел до Верховного Суда РФ. Рассмотрев материалы дела, ВС РФ в определении от 12.03.2025 №А40-195715/2023 отменил решения нижестоящих судебных инстанций и встал на сторону организации-налогоплательщика.

ВС РФ указал, что налоги, уплаченные до 2023 года, можно вернуть при условии соблюдения 3-летнего срока на их возврат, который ранее был установлен в соответствии с п.7 ст.78 НК РФ. При этом указанный 3-летний срок следует отсчитывать не со дня уплаты налога в излишнем размере, а со дня, когда налогоплательщику стало известно о факте излишней уплаты налога.

О факте переплаты налогоплательщику становится известно к моменту представления налоговой декларации по итогам истекшего налогового периода. Таким образом, заключил ВС РФ, срок на возврат переплаченных до 2023 года имущественных налогов следует исчислять не со дня уплаты налогов или авансовых платежей по ним, а с момента представления налоговой декларации по итогам налогового периода. Это касается всех налогов, которые самостоятельно исчисляют, декларируют и уплачивают налогоплательщики.

Обзоры налоговых споров