Если в учетной политике налогоплательщика методика ведения раздельного учета НДС не отражена, но фактически раздельный учет налогоплательщиком ведется, отказ налогового органа в вычете "входного" НДС является необоснованным и незаконным. Такой вывод изложен в постановлении ФАС Московского округа от 19.10.2009 № КА-А40/10622-09.

Услуги по разработке программ для ЭВМ или отдельных частей таких программ по договорам подряда подлежат обложению НДС. Об этом сказано в письме Минфина России от 21.09.2009 № 03-07-07/69.

Новое Определение ВАС РФ от 08.10.2009 № ВАС-11175/09 посвящено порядку применения НДС в случае предоставления ретроспективных скидок при реализации товаров через сеть дистрибьюторов. Фактически в документе рассмотрен вопрос, на который нет четкого ответа в НК РФ: налоговую базу какого периода нужно корректировать при предоставлении скидки после реализации товара - базу периода реализации или периода предоставления скидки?

Уплаченный на территории иностранного государства НДС при формировании налоговой базы по налогу на прибыль организаций не учитывается. Такой вывод изложен в письме Минфина России от 06.10.2009 № 03-03-06/1/644.

При выбытии основных средств до истечения срока их полезного использования "входной" НДС по ним, принятый ранее к вычету, восстанавливать не нужно. Об этом сказано в постановлении ФАС Северо-Кавказского округа от 24.09.2009 по делу № А32-14927/2008-51/113.

НДС, предъявленный исполнителем работ, связанных с ликвидацией (демонтажем) основного средства, принять к вычету нельзя. Об этом сказано в постановлении ФАС Северо-Западного округа от 02.10.2009 по делу № А56-41978/2008.

Новое письмо финансового ведомства посвящено вопросу применения НДС по агентскому договору. А именно - при перечислении авансовых платежей агенту, приобретающему товары от своего имени, но за счет принципала (письмо от 02.10.2009 № 03-07-11/246).

Внесены дополнения в формат представления налоговых деклараций в электронном виде (приказ ФНС России от 30.09.2009 № ММ-7-6/482@). В частности, в Состав и структуру показателей налоговой декларации по косвенным налогам (налогу на добавленную стоимость и акцизам) при ввозе товаров на территорию Российской Федерации с территории Республики Беларусь, утв. приказом ФНС России от 11.01.2007 № САЭ-3-13/3@.

Накладные ТОРГ-12, в которых не указана дата получения товаров налогоплательщиком, считаются ненадлежащими первичными документами. Право на вычет НДС по таким товарам ФАС Северо-Западного округа посчитал не подтвержденным (постановление от 03.09.2009 по делу № А05-14740/2008).

В письме ФНС России от 24.08.2009 № 3-1-07/674 приведены разъяснения по вопросу заполнения документов и расчета НДС в одной из весьма распространенных ситуаций. Речь идет о случае установления цены в иностранной валюте или условной денежной единице (притом, что оплата осуществляется в рублях). Если отгрузка и оформление счета-фактуры предшествуют оплате, вопросы по расчету НДС возникают как у продавца, так и у покупателя.