Больничный в персучете

Сотрудник во 2 квартале был на больничном. При формировании сведений перс. учета он (сотрудник) попадает в отдельную пачку СЗВ, где нет начислений, а отражен только стаж и гражданско-правовой договор (хотя он работает по трудовому). И еще попадает в общую пачку , где отражены его начисления , а стаж с 01.04.13 по 30.06.2013, т.е. без учета его больничного. Звонили в обновляющую нас организацию, сказали, что все последние обновления сделаны и почему у нас такая ошибка они не понимают и помочь нам не могут. Посоветуйте, что делать?